Las merluzas y bacalaos negros son peces que habitan las aguas profundas y en México estos recursos son considerados como potenciales debido a la falta de embarcaciones para su captura. Con una pesca fundamentalmente costera, México no ha apostado de forma decidida incrementar la explotación de los recursos de zonas profundas, los cuales ocupan una área de casi el 98% de la zona económica exclusiva. Las merluzas y bacalaos negros se capturan de modo ocasional en las costas de Baja California mediante permisos de pesca de fomento. Como consecuencia existen pocas bases científicas que permitan su manejo sustentable. Por ejemplo, existe controversia sobre el número de especies de merluzas en agua de Baja California; y a pesar que se han reportado tres, Merluccius productus, M. angustimanus y M. hernandezi, hay incertidumbre sobre su autenticidad. Para el bacalao negro sólo se ha reportado una especie Anoplopoma fimbria.

Tanto las merluzas como los bacalaos negros muestran migraciones a lo largo de las costas del Pacífico nororiental, por lo que representan recursos compartidos entre México, Estados Unidos y Canadá, aunque los países del norte tienen una pesquería comercial bien establecida. Ante esta situación, México requiere transformar su pesquería potencial en una comercial y además necesita generar conocimientos científicos que ayuden en la administración de las pesquerías, los cuales podrán se útiles como instrumentos de manejo y negociación sobre el derecho patrimonial de los recursos explotables compartidos.

El propósito de esta propuesta es emplear análisis de ADN y descripciones de la forma del pez para determinar el número de especies de merluzas en las costas del Pacífico Nororiental, así como también identificar poblaciones distintas y estimar mezclas de poblaciones en las merluzas y de bacalaos negros en los alrededores de la península de Baja California.

Los resultados preliminares encontrados hasta ahora rechazan la idea de la existencia de tres especies de merluzas en el Pacífico Nororiental, por lo que con este estudio se propone la sola ocurrencia de M. productus, además esta especie muestra poblaciones genéticamente distintas a lo largo de su distribución, dicha diferenciación genética de poblaciones requiere de medidas de administración pesquera específicas por población. Para el caso del bacalao, los datos del ADN, indican que esta especies está constituida de una sola población genéticamente homogénea desde Alaska hasta la Bahía de San Quintín. Estos conocimientos auxiliarán a México en los esfuerzos de administrar los recursos potenciales compartidos con los Estados Unidos y Canadá.