El laboratorio de Edafología tiene la finalidad de determinar los parámetros físicos y químicos a los diferentes tipos de suelos, sedimentos marinos, compostas, vermi-compostas y lixiviados orgánicos; utilizando extractos acuosos, alcalinos o digestiones ácidas; para detectar los niveles óptimos o carencias de nutrientes en macro elementos, para una excelente fertilización o enmienda.
Por la naturaleza de las investigaciones y servicios de apoyo que se prestan a la comunidad institucional y externa, en el laboratorio la mayoría de las determinaciones están basadas en técnicas tradicionales; por ejemplo la determinación de fósforo total y fósforo soluble en extractos acuosos, ácidos o alcalinos mediante el método Meta-vanado-molibdo-fosfórico. Así mismo se han adaptado a micro escala. También se implementó la técnica para la determinación de materia orgánica aplicando el método de Walkley y Black 1934, modificado por Jackson 1956.